Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L2Q9P2F8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms