Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDL2Q9NX52 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms