Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASF1BQ9NVP2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms