Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATAD3AQ9NVI7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms