Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPMQ9NSP4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms