Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FSCN3Q9NQT6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms