Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP1Q9GZU7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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