Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTMR12Q9C0I1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms