Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms