Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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