Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms