Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TIMM29Q9BSF4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms