Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEC22CQ9BRL7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms