Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK3Q9BQ16 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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