Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF6Q99612 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF6Q99612 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF6Q99612 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms