Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSF3RQ99062 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms