Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCLRE1CQ96SD1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCLRE1CQ96SD1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms