Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL15Q96M94 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms