Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DCHS1Q96JQ0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms