Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCC12Q96J65 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCC12Q96J65 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms