Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHDQ96IW2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms