Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED3Q96IU2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED3Q96IU2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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