Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MFSD3Q96ES6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms