Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms