Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF34Q969K3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF34Q969K3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms