Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKD2Q969F2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms