Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms