Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPBP1Q92547 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPBP1Q92547 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms