Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C11orf40Q8WZ69 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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