Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY2Q8WXA3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms