Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms