Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD12Q8N8I0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms