Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms