Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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