Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C9orf40Q8IXQ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf40Q8IXQ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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