Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TCF23Q7RTU1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TCF23Q7RTU1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TCF23Q7RTU1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TCF23Q7RTU1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms