Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM5Q71RC9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms