Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP31Q70CQ4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP31Q70CQ4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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