Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXD4L3Q6VB84 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms