Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VITQ6UXI7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms