Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX40

TMEM107, Transmembrane protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM107Q6UX40 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM107Q6UX40 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM107Q6UX40 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms