Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBED9Q6R2W3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms