Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms