Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms