Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEF1DP3Q658K8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms