Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM46CQ5VWP2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM46CQ5VWP2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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