Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms