Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP350Q5VT06 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms