Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC158Q5M9N0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms