Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN4Q5BKX8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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